本所於民國39年12月1日成立，當時辦公室係租借民宅，並暫借港警所地下室拘留所羈押男性被告，暫借警察局拘留所羈押女性被告。至民國40年12月在基隆市崇法街現址(面積9,212平方公尺，換算約2,787坪)興建看守所，羈押一審刑事被告；民國60年7月1日附設少年觀護所；民國70年4月1日設立基隆監獄基隆分監，收容刑期未滿六月受刑人，以疏解監獄人犯擁擠；民國87年5月成立附設觀察勒戒處所收容受觀察勒戒人。民國99年7月17日，本所女性之受刑人、被告及受觀察勒戒人移禁至臺北女子看守所，女性收容少年移至臺北少年觀護所收容。